北京市京圃园生物工程有限公司是由北京市科委批准的高新技术企业。公司成立于1998年，依托农业科学院的技术优势，主要从事农业微生物、环保工程、土壤肥料、绿色农业种植等产业项目的技术开发及产品生产。目前公司拥有中高级技术人员16人。
北京市京圃园生物工程有限公司以“立足农业，面向环保”为指导思想，致力于“圃园”农业经营网络体系的建立；公司以“崇尚知识，尊重人才”为宗旨，注重以知识的力量改变我国农业产业落后的局面，用科技手段促进农业产业结构的调整、农业生产水平的提高。
1998年，京圃园生物工程有限公司注册成立，开始涉及生态农业领域。
1999年，公司专家队伍在造成我国农村主要污染物的畜禽粪便的无害化处理的研究上取得重大突破。采用微生物发酵技术，使之除臭，腐熟成为有机农业种植所必需的、优质的生物有机肥。
2000年，有机废物发酵菌曲研制成功，并尝试运用特许加盟的方式带动下游产业的发展。
2001年，公司生产的“有机废物发酵菌曲”取得农业部颁发的登记证书，标志着我国发酵剂产品完全依赖进口的结束。
2002年7月，人大副委员长姜春云视察“圃园”加盟企业，并对企业为现代农业生态 系统所做的贡献表示赞扬；10月，公司生产的“生物有机肥”成为首批取得农业部颁发登记证的产品。
2003年，“有机废物微生物发酵生产生物有机肥”技术通过了以国家环保总局金鉴明院士为专家委员会主任的成果鉴定，成为国内同行业中家具有知识产权并通过省部级鉴定的技术。
2004年5月，公司承担火炬计划项目“有机废物微生物发酵生产生物有机肥” 技术；7月，公司被批准为北京市高新技术企业；10月，“有机废物微生物发酵生产生物有机肥” 技术被评为北京市金桥奖项目。
2005年3月，“有机废物微生物发酵生产生物有机肥” 技术被评为“2005年国家重点环境保护实用技术（A类）”；5月，公司承担星火计划项目“有机废弃物微生物发酵剂及生物有机肥产业化开发”；10月，该项目荣获第二届??东盟博览会先进实用技术专题展参展项目；11月，该项成果通过国家环保总局环境保护科技成果登记。
2006年，该项技术被评为2005年国家环境保护科学技术奖。
2007年，“圃园”体系下已经发展各地40多家加盟企业，“圃园”生态农业体系初现规模。
2008年，公司在丹麦政府及丹麦驻华大使馆的支持下，与丹麦循环利用中心共同出资在组建了合资子公司。引进丹麦、德国先进技术处理污水，进军环保市场，从而进一步诠释了我公司“立足环保，面向农业”的发展理念
京圃园公司强调团队的力量，强调合作精神，各加盟企业将在极富凝聚力的品牌率领下，在充满创新活力的团队精神鼓舞下，创造强大而务实的有机农业生产经营体系。